嘉靖二十九年，倭寇偷袭西安寺。石井镖局总镖头林钦的三个儿子中，老大林展翔(张磊 饰)和老三林展浩(张晋 饰)被僧兵救下带回南少林，老二林展鹏(张帆 饰)被倭兵掳走。林展鹏被倭军的首领三枝图田(石兆琪 饰)收为养子，改名“三枝乱步”并传授刀法，迅速成为浪人中武功超凡者。林展翔自幼习武剑法超群，这场浩劫在他的心里留下严重阴影，于是逃离寺院一心遁世。林展翔在陆家茶园喜欢上了茶园主的女儿陆燕怀(孙文婷 饰)。嘉靖三十年倭寇再次入侵，陆燕怀被残忍折磨而死。林展浩在南少林刻苦习武成为武林高手，并和惠安女黄榕艳情投意合。三枝乱步杀死养父三枝图田后成为军团的首脑。在与倭寇一次次的战事中，林展翔、林展鹏、林展浩三兄弟经历了多次争战，最终，林展浩皈依佛门，林展翔成为了新一代武僧大师，林展鹏则选择了自杀，在大哥林展翔怀中死去。